209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3489 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3489  transposase, IS4  100 
 
 
310 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1473  transposase, IS4  95.48 
 
 
400 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2062  transposase, IS4  95.48 
 
 
400 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2254  transposase, IS4  95.48 
 
 
400 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2960  transposase, IS4  95.48 
 
 
400 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0212641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3325  transposase, IS4  95.48 
 
 
400 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2240  IS4 family transposase  84.19 
 
 
400 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0969816  normal  0.0243292 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1919  transposase IS4 family protein  84.19 
 
 
400 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.035581  normal  0.0427868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0461  transposase, IS4 family protein  84.19 
 
 
400 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1916  transposase IS4 family protein  83.23 
 
 
400 aa  547  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.511256  normal  0.075627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1846  transposase, IS4  67.95 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.79186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1945  transposase, IS4  67.95 
 
 
420 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2598  transposase, IS4  67.95 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2740  transposase, IS4  67.95 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2744  transposase, IS4  67.95 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3451  transposase, IS4  67.95 
 
 
402 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0863  transposase, IS4  67.95 
 
 
402 aa  434  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.174344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1387  transposase, IS4  67.95 
 
 
402 aa  434  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1943  transposase, IS4  67.63 
 
 
420 aa  436  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05982  hypothetical protein  55.23 
 
 
399 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05054  hypothetical protein  55.23 
 
 
399 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08194  transposase  55.23 
 
 
399 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.679296  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01470  hypothetical protein  55.23 
 
 
399 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06074  hypothetical protein  55.23 
 
 
399 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01664  hypothetical protein  55.23 
 
 
399 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02007  hypothetical protein  55.23 
 
 
399 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02494  hypothetical protein  55.23 
 
 
399 aa  364  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02009  hypothetical protein  55.23 
 
 
405 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02811  hypothetical protein  55.23 
 
 
399 aa  363  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01925  hypothetical protein  55.23 
 
 
399 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05883  hypothetical protein  54.9 
 
 
346 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1658  transposase, IS4 family protein  78.03 
 
 
220 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0196092  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02579  hypothetical protein  53.55 
 
 
399 aa  356  1.9999999999999998e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4716  transposase (IS4 family)  47.9 
 
 
402 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189582  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1603  IS10 transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4777  IS10 transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.271469  normal  0.676926 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0820  transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  9e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00771423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2715  IS10 transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3181  IS10 transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4558  IS10 transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2541  IS10, transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.2795e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0337  IS10 transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0524  IS10 transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1590  IS10 transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3046  IS10 transposase  47.9 
 
 
402 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0146  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0731  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1541  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1974  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2226  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2283  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3567  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3625  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4000  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4239  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4437  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0102  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0136  ISSod3, transposase  51.47 
 
 
404 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3499  ISSod3, transposase  51.14 
 
 
404 aa  288  6e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1244  ISSod3, transposase  51.14 
 
 
404 aa  288  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4432  ISSod3, transposase  51.14 
 
 
404 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2465  IS4 family transposase  50.16 
 
 
404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000609587  hitchhiker  0.0000155014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1636  transposase, IS4 family protein  50.49 
 
 
460 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02577  hypothetical protein  54.71 
 
 
312 aa  271  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4275.4  transposase  55.46 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00244  hypothetical protein  39.65 
 
 
397 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05505  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03328  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01147  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01480  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01644  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01678  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06600  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01845  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06053  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02168  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02183  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06476  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05717  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06290  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02842  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02984  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06205  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06115  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02343  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06149  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07124  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06332  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05302  hypothetical protein  38.31 
 
 
397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06221  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05129  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05114  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05431  hypothetical protein  38.95 
 
 
397 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03453  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00547  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00551  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00587  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00840  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05902  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  210  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03107  hypothetical protein  37.97 
 
 
397 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>