27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2292 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2292  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  361  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3158  transposase, IS4 family protein  43.02 
 
 
416 aa  129  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4456  hypothetical protein  42.46 
 
 
417 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1486  hypothetical protein  42.13 
 
 
417 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0978  hypothetical protein  41.34 
 
 
417 aa  121  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.764358  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1598  hypothetical protein  41.34 
 
 
417 aa  120  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1754  hypothetical protein  40.78 
 
 
417 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  40.78 
 
 
649 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2547  hypothetical protein  40.78 
 
 
417 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0495707  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4509  hypothetical protein  40.78 
 
 
417 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0068  transposase, IS4 family protein  30.6 
 
 
397 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.974421  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4720  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3831  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3610  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3532  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3427  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000920727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3220  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.390647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3071  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.52529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2890  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0289371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2872  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2461  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1934  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000387173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1209  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0722892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0848  transposase IS4 family protein  28.82 
 
 
414 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4089  transposase IS4 family protein  31.76 
 
 
401 aa  45.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.034496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1094  transposase IS4 family protein  31.76 
 
 
401 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3939  transposase IS4 family protein  31.76 
 
 
401 aa  45.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>