34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2547 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0978  hypothetical protein  95.44 
 
 		 417 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.764358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1486  hypothetical protein  96.4 
 
 		 417 aa  691    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1598  hypothetical protein  97.6 
 
 		 417 aa  697    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1754  hypothetical protein  96.16 
 
 		 417 aa  677    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2547  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  808    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0495707  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  98.32 
 
 		 649 aa  806    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3158  transposase, IS4 family protein  94.24 
 
 		 416 aa  712    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4456  hypothetical protein  94.72 
 
 		 417 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4509  hypothetical protein  96.4 
 
 		 417 aa  688    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2292  hypothetical protein  40.78 
 
 		 185 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1934  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000387173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3831  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3220  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.390647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2461  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2872  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2890  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0289371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3071  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.52529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1209  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0722892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3427  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000920727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0848  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3532  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3610  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4720  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0444  transposase, IS4 family protein  26.27 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000119461  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1094  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3939  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4089  transposase IS4 family protein  27.55 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.034496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0068  transposase, IS4 family protein  27.4 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.974421  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2039  transposase IS4 family protein  25.31 
 
 		 378 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3112  transposase IS4 family protein  26.48 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  25.76 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5389  transposase IS4 family protein  22.5 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5516  transposase IS4 family protein  22.5 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.378571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>