41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3158 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0978  hypothetical protein  90.89 
 
 		 417 aa  654    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.764358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1486  hypothetical protein  96.16 
 
 		 417 aa  703    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1598  hypothetical protein  93.76 
 
 		 417 aa  683    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1754  hypothetical protein  90.65 
 
 		 417 aa  647    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2547  hypothetical protein  93.53 
 
 		 417 aa  681    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0495707  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  94.24 
 
 		 649 aa  698    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3158  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 416 aa  812    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4456  hypothetical protein  92.57 
 
 		 417 aa  667    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4509  hypothetical protein  93.29 
 
 		 417 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326946 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2292  hypothetical protein  43.02 
 
 		 185 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0068  transposase, IS4 family protein  29.79 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.974421  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1209  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0722892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3220  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.390647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1934  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000387173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3427  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000920727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2461  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2872  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2890  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0289371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3071  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.52529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0848  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3532  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3610  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3831  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4720  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1094  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3939  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4089  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.034496  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3112  transposase IS4 family protein  27.24 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0444  transposase, IS4 family protein  27.19 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000119461  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2039  transposase IS4 family protein  24.37 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5389  transposase IS4 family protein  25.24 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5516  transposase IS4 family protein  25.24 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.378571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4105  transposase IS4 family protein  25.36 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0171  hypothetical protein  24.04 
 
 		 257 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353474  normal  0.731935 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2440  transposase, IS4  25.6 
 
 		 352 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1784  transposase, IS4  25.6 
 
 		 352 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4535  transposase IS4 family protein  22.56 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  26.09 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25520  Transposase, IS4  27.5 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45960  Transposase, IS4  26.23 
 
 		 397 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>