102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4920 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4920  putative acyltransferase  100 
 
 
300 aa  617  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2503  putative acyltransferase  79.19 
 
 
303 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2109  putative acyltransferase  78.86 
 
 
303 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02093  putative acyltransferase  76.59 
 
 
300 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1456  putative acyltransferase  62.98 
 
 
333 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2744  putative acyltransferase  57.48 
 
 
305 aa  351  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.244294  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4686  putative acyltransferase  55.05 
 
 
304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53490  putative acyltransferase  55.05 
 
 
304 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3794  putative acyltransferase  50.84 
 
 
317 aa  315  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03628  putative acyltransferase  49.83 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1168  acyltransferase family protein  51.35 
 
 
307 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0282  putative acyltransferase  49.32 
 
 
294 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.028108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3646  putative acyltransferase  52.88 
 
 
298 aa  310  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1006  putative acyltransferase  50.33 
 
 
301 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829221  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0330  putative acyltransferase  50.84 
 
 
301 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4173  putative acyltransferase  49.66 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2870  putative acyltransferase  47.3 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  hitchhiker  0.00487826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0348  putative acyltransferase  49.16 
 
 
300 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0409  putative acyltransferase  50 
 
 
301 aa  299  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4055  putative acyltransferase  49.16 
 
 
300 aa  298  5e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0029965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1162  putative acyltransferase  47.39 
 
 
300 aa  298  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.389136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3290  putative acyltransferase  50.52 
 
 
306 aa  297  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3422  putative acyltransferase  47.77 
 
 
299 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3941  putative acyltransferase  47.16 
 
 
298 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4043  putative acyltransferase  47.16 
 
 
300 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4136  putative acyltransferase  47.16 
 
 
298 aa  295  6e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4017  putative acyltransferase  47.16 
 
 
300 aa  294  9e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3821  putative acyltransferase  48.49 
 
 
297 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3640  putative acyltransferase  46.82 
 
 
298 aa  294  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0417  putative acyltransferase  47.64 
 
 
298 aa  294  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3625  putative acyltransferase  48.48 
 
 
300 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0319  putative acyltransferase  48.48 
 
 
300 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1997  putative acyltransferase  48.64 
 
 
304 aa  291  6e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4830  putative acyltransferase  46.39 
 
 
303 aa  291  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0347  putative acyltransferase  47.55 
 
 
302 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0879  putative acyltransferase  49.81 
 
 
300 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4044  putative acyltransferase  46.46 
 
 
314 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4137  putative acyltransferase  46.62 
 
 
314 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4018  putative acyltransferase  47.14 
 
 
314 aa  279  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3942  putative acyltransferase  46.62 
 
 
314 aa  278  6e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2692  putative acyltransferase  45.76 
 
 
299 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0844158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0281  putative acyltransferase  47.67 
 
 
315 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0103155 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0416  putative acyltransferase  45.95 
 
 
301 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3626  putative acyltransferase  46.76 
 
 
313 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0318  putative acyltransferase  46.4 
 
 
313 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0329  putative acyltransferase  45.36 
 
 
316 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4174  putative acyltransferase  44.95 
 
 
306 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3822  putative acyltransferase  46.04 
 
 
313 aa  266  4e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06030  putative acyltransferase  48.13 
 
 
295 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.015465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0566  putative acyltransferase  48.13 
 
 
295 aa  262  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3641  putative acyltransferase  44.93 
 
 
314 aa  258  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3291  putative acyltransferase  43.62 
 
 
313 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4229  putative acyltransferase  44.11 
 
 
302 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000366045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4208  putative acyltransferase  43.43 
 
 
302 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4279  putative acyltransferase  43.77 
 
 
302 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03748  predicted endonuclease  42.23 
 
 
310 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.02108  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4086  putative acyltransferase  42.23 
 
 
301 aa  249  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4380  putative acyltransferase  42.23 
 
 
301 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4244  putative acyltransferase  42.23 
 
 
318 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00468249  normal  0.164529 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5303  putative acyltransferase  42.23 
 
 
318 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000210001  normal  0.689009 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03697  hypothetical protein  42.23 
 
 
310 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0194734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4325  putative acyltransferase  43.77 
 
 
302 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4386  putative acyltransferase  43.77 
 
 
302 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0215545  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4335  putative acyltransferase  42.81 
 
 
301 aa  249  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0165899  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4124  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.89 
 
 
310 aa  248  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00625279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4153  putative acyltransferase  41.89 
 
 
310 aa  248  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00244028  hitchhiker  0.0000165224 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0408  putative acyltransferase  45 
 
 
307 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2486  putative acyltransferase  43.64 
 
 
294 aa  247  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.400705  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0950  putative acyltransferase  39.51 
 
 
297 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4724  putative acyltransferase  48.13 
 
 
307 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4873  putative acyltransferase  45.39 
 
 
295 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.489512  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5198  putative acyltransferase  46.13 
 
 
306 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0332  putative acyltransferase  45.39 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244482  normal  0.228044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0358  putative acyltransferase  45.52 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34735  normal  0.269668 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0920  putative acyltransferase  40.43 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05860  putative acyltransferase  49.18 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0452  acyltransferase family protein  46.75 
 
 
299 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.621143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4125  putative acyltransferase  46.21 
 
 
296 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0355  putative acyltransferase  45.15 
 
 
295 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78397 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002044  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.51 
 
 
292 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00406  putative acyltransferase  41.61 
 
 
292 aa  240  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3423  putative acyltransferase  41.28 
 
 
313 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1819  putative acyltransferase  41.46 
 
 
305 aa  237  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0991283  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2169  putative acyltransferase  38.89 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.141327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0012  putative acyltransferase  38.89 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2088  putative acyltransferase  39.58 
 
 
322 aa  231  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2147  putative acyltransferase  38.83 
 
 
328 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0632358  normal  0.568225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4888  putative acyltransferase  41.67 
 
 
296 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514103  hitchhiker  0.000000684246 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1316  putative acyltransferase  37.8 
 
 
320 aa  226  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1105  putative acyltransferase  36.77 
 
 
320 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0819503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4056  putative acyltransferase  39.58 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0720932  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0043  putative acyltransferase  37.98 
 
 
289 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0148  putative acyltransferase  36.94 
 
 
296 aa  205  8e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.28872  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3557  putative acyltransferase  35.49 
 
 
326 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.554768  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03629  putative acyltransferase  37.97 
 
 
297 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2177  putative acyltransferase  36.57 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000219754  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.79 
 
 
235 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0735  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.44 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.985131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2389  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.44 
 
 
241 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2213  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.68 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0965505  hitchhiker  0.00600362 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>