107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2744 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2744  putative acyltransferase  100 
 
 
305 aa  624  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.244294  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2109  putative acyltransferase  57.76 
 
 
303 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2503  putative acyltransferase  57.76 
 
 
303 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_003296  RS02093  putative acyltransferase  58.05 
 
 
300 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3794  putative acyltransferase  53.14 
 
 
317 aa  357  9e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4686  putative acyltransferase  56.8 
 
 
304 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53490  putative acyltransferase  56.8 
 
 
304 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677528 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4920  putative acyltransferase  57.97 
 
 
300 aa  351  8e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1006  putative acyltransferase  51.88 
 
 
301 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829221  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1168  acyltransferase family protein  51.54 
 
 
307 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1456  putative acyltransferase  53.08 
 
 
333 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3646  putative acyltransferase  55.44 
 
 
298 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1997  putative acyltransferase  51.64 
 
 
304 aa  311  6.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2692  putative acyltransferase  48.83 
 
 
299 aa  311  9e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0844158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4830  putative acyltransferase  49.83 
 
 
303 aa  309  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03628  putative acyltransferase  48.99 
 
 
304 aa  308  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1162  putative acyltransferase  50.7 
 
 
300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.389136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4055  putative acyltransferase  50.51 
 
 
300 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0029965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2870  putative acyltransferase  49.49 
 
 
301 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  hitchhiker  0.00487826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0879  putative acyltransferase  52.04 
 
 
300 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3422  putative acyltransferase  50.34 
 
 
299 aa  298  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0282  putative acyltransferase  49.65 
 
 
294 aa  295  6e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.028108 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4044  putative acyltransferase  47.06 
 
 
314 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0417  putative acyltransferase  47.47 
 
 
298 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0348  putative acyltransferase  48.66 
 
 
300 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4137  putative acyltransferase  45.9 
 
 
314 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3941  putative acyltransferase  48.11 
 
 
298 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3942  putative acyltransferase  45.9 
 
 
314 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3625  putative acyltransferase  48.64 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0319  putative acyltransferase  48.64 
 
 
300 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4018  putative acyltransferase  46.08 
 
 
314 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4017  putative acyltransferase  47.77 
 
 
300 aa  285  7e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3626  putative acyltransferase  45.85 
 
 
313 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4136  putative acyltransferase  47.42 
 
 
298 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0318  putative acyltransferase  46.18 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06030  putative acyltransferase  50.94 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.015465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3822  putative acyltransferase  45.85 
 
 
313 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4043  putative acyltransferase  47.08 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0566  putative acyltransferase  50.94 
 
 
295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0347  putative acyltransferase  46.32 
 
 
302 aa  277  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3821  putative acyltransferase  48.28 
 
 
297 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3640  putative acyltransferase  46.44 
 
 
298 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0281  putative acyltransferase  43.85 
 
 
315 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0103155 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3641  putative acyltransferase  45.25 
 
 
314 aa  276  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0329  putative acyltransferase  42.86 
 
 
316 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0332  putative acyltransferase  50.19 
 
 
295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244482  normal  0.228044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4873  putative acyltransferase  49.81 
 
 
295 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.489512  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0409  putative acyltransferase  46.21 
 
 
301 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4724  putative acyltransferase  52.87 
 
 
307 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0358  putative acyltransferase  49.44 
 
 
295 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34735  normal  0.269668 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3290  putative acyltransferase  49.47 
 
 
306 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0355  putative acyltransferase  49.44 
 
 
295 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0330  putative acyltransferase  47.42 
 
 
301 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0416  putative acyltransferase  42.57 
 
 
301 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4174  putative acyltransferase  42.14 
 
 
306 aa  268  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4208  putative acyltransferase  43.05 
 
 
302 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0452  acyltransferase family protein  51.19 
 
 
299 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.621143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4279  putative acyltransferase  43.39 
 
 
302 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4325  putative acyltransferase  43.39 
 
 
302 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4386  putative acyltransferase  43.39 
 
 
302 aa  266  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0215545  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3291  putative acyltransferase  43.81 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4229  putative acyltransferase  43.39 
 
 
302 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000366045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4173  putative acyltransferase  43.79 
 
 
302 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5198  putative acyltransferase  49.06 
 
 
306 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4244  putative acyltransferase  43.05 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00468249  normal  0.164529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03748  predicted endonuclease  43.05 
 
 
310 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.02108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03697  hypothetical protein  43.05 
 
 
310 aa  262  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0194734  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5303  putative acyltransferase  43.05 
 
 
318 aa  262  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000210001  normal  0.689009 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4380  putative acyltransferase  43.05 
 
 
301 aa  261  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4086  putative acyltransferase  43.05 
 
 
301 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4124  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.71 
 
 
310 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00625279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4153  putative acyltransferase  42.71 
 
 
310 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00244028  hitchhiker  0.0000165224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4335  putative acyltransferase  43.05 
 
 
301 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0165899  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0950  putative acyltransferase  42.81 
 
 
297 aa  258  6e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4125  putative acyltransferase  48.12 
 
 
296 aa  259  6e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0920  putative acyltransferase  42.01 
 
 
297 aa  256  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3423  putative acyltransferase  40.66 
 
 
313 aa  257  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2486  putative acyltransferase  43.73 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.400705  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4888  putative acyltransferase  42.61 
 
 
296 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514103  hitchhiker  0.000000684246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1819  putative acyltransferase  45.39 
 
 
305 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0991283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05860  putative acyltransferase  45.45 
 
 
295 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0408  putative acyltransferase  42.91 
 
 
307 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2169  putative acyltransferase  39.07 
 
 
300 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.141327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0012  putative acyltransferase  39.07 
 
 
300 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00406  putative acyltransferase  43.08 
 
 
292 aa  236  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4056  putative acyltransferase  41.67 
 
 
298 aa  229  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0720932  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0148  putative acyltransferase  39.59 
 
 
296 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.28872  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002044  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.99 
 
 
292 aa  225  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2177  putative acyltransferase  39.25 
 
 
296 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000219754  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0043  putative acyltransferase  36.95 
 
 
289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2147  putative acyltransferase  38.8 
 
 
328 aa  219  6e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0632358  normal  0.568225 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2088  putative acyltransferase  39.06 
 
 
322 aa  218  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1316  putative acyltransferase  35.39 
 
 
320 aa  218  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1105  putative acyltransferase  35.67 
 
 
320 aa  217  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0819503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03629  putative acyltransferase  44.14 
 
 
297 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3557  putative acyltransferase  34.01 
 
 
326 aa  199  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.554768  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0735  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.57 
 
 
241 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.985131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2389  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.57 
 
 
241 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2015  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.75 
 
 
260 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2453  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.29 
 
 
241 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0904176  normal  0.167894 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>