129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4055 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_4055  putative acyltransferase  100 
 
 
300 aa  614  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0029965  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03628  putative acyltransferase  66.67 
 
 
304 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4043  putative acyltransferase  57.86 
 
 
300 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0348  putative acyltransferase  58.53 
 
 
300 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3941  putative acyltransferase  57.53 
 
 
298 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4136  putative acyltransferase  57.53 
 
 
298 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3625  putative acyltransferase  58.19 
 
 
300 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0319  putative acyltransferase  58.19 
 
 
300 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0282  putative acyltransferase  56.52 
 
 
294 aa  376  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.028108 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4017  putative acyltransferase  57.53 
 
 
300 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3821  putative acyltransferase  57 
 
 
297 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3640  putative acyltransferase  57.19 
 
 
298 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69042  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4173  putative acyltransferase  55.67 
 
 
302 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0409  putative acyltransferase  57.24 
 
 
301 aa  363  2e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3422  putative acyltransferase  55.93 
 
 
299 aa  362  4e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0417  putative acyltransferase  55.41 
 
 
298 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.124497  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3290  putative acyltransferase  56.33 
 
 
306 aa  359  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.502133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0330  putative acyltransferase  55.67 
 
 
301 aa  357  9e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1162  putative acyltransferase  55.56 
 
 
300 aa  343  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.389136  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4830  putative acyltransferase  52 
 
 
303 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2870  putative acyltransferase  54.48 
 
 
301 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  hitchhiker  0.00487826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3794  putative acyltransferase  48.17 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1997  putative acyltransferase  48.64 
 
 
304 aa  301  7.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2692  putative acyltransferase  48.84 
 
 
299 aa  297  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0844158  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2744  putative acyltransferase  50.51 
 
 
305 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.244294  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02093  putative acyltransferase  48.12 
 
 
300 aa  295  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2503  putative acyltransferase  48.62 
 
 
303 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2109  putative acyltransferase  48.62 
 
 
303 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4920  putative acyltransferase  49.64 
 
 
300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3646  putative acyltransferase  45.2 
 
 
298 aa  279  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1006  putative acyltransferase  46 
 
 
301 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4686  putative acyltransferase  46.76 
 
 
304 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53490  putative acyltransferase  46.76 
 
 
304 aa  275  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000677528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1168  acyltransferase family protein  45.67 
 
 
307 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118723  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0950  putative acyltransferase  45.36 
 
 
297 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0920  putative acyltransferase  45.36 
 
 
297 aa  271  7e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4873  putative acyltransferase  48 
 
 
295 aa  271  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.489512  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0879  putative acyltransferase  48.16 
 
 
300 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5198  putative acyltransferase  48.73 
 
 
306 aa  268  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0281  putative acyltransferase  47.52 
 
 
315 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0103155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0332  putative acyltransferase  46.55 
 
 
295 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.244482  normal  0.228044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06030  putative acyltransferase  48.53 
 
 
295 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.015465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0566  putative acyltransferase  48.53 
 
 
295 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0355  putative acyltransferase  46.55 
 
 
295 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0358  putative acyltransferase  46.55 
 
 
295 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34735  normal  0.269668 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4244  putative acyltransferase  43.42 
 
 
318 aa  262  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00468249  normal  0.164529 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03748  predicted endonuclease  43.09 
 
 
310 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.02108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03697  hypothetical protein  43.09 
 
 
310 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0194734  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4086  putative acyltransferase  43.09 
 
 
301 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5303  putative acyltransferase  43.09 
 
 
318 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000210001  normal  0.689009 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4380  putative acyltransferase  43.09 
 
 
301 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000733463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4124  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.76 
 
 
310 aa  259  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00625279  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4153  putative acyltransferase  42.76 
 
 
310 aa  259  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00244028  hitchhiker  0.0000165224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4335  putative acyltransferase  43.09 
 
 
301 aa  259  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0165899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0452  acyltransferase family protein  47.1 
 
 
299 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.621143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4724  putative acyltransferase  51.42 
 
 
307 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2486  putative acyltransferase  41.36 
 
 
294 aa  258  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.400705  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1456  putative acyltransferase  44.98 
 
 
333 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0347  putative acyltransferase  46.18 
 
 
302 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4137  putative acyltransferase  44.63 
 
 
314 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3942  putative acyltransferase  44.63 
 
 
314 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4044  putative acyltransferase  44.82 
 
 
314 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0329  putative acyltransferase  42.81 
 
 
316 aa  248  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0318  putative acyltransferase  45.88 
 
 
313 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4018  putative acyltransferase  44.82 
 
 
314 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1819  putative acyltransferase  43.06 
 
 
305 aa  246  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0991283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4125  putative acyltransferase  51.3 
 
 
296 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4279  putative acyltransferase  40.73 
 
 
302 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4229  putative acyltransferase  40.73 
 
 
302 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000366045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4208  putative acyltransferase  40.4 
 
 
302 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4325  putative acyltransferase  40.73 
 
 
302 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.702352  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4386  putative acyltransferase  40.73 
 
 
302 aa  244  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0215545  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3822  putative acyltransferase  45.52 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4174  putative acyltransferase  42.95 
 
 
306 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3291  putative acyltransferase  42.38 
 
 
313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.497498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3626  putative acyltransferase  45.52 
 
 
313 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3641  putative acyltransferase  45.52 
 
 
314 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2169  putative acyltransferase  41.89 
 
 
300 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.141327  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0012  putative acyltransferase  41.89 
 
 
300 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4888  putative acyltransferase  39.8 
 
 
296 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514103  hitchhiker  0.000000684246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3423  putative acyltransferase  42.86 
 
 
313 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0416  putative acyltransferase  41.61 
 
 
301 aa  238  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.775198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05860  putative acyltransferase  45.16 
 
 
295 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4056  putative acyltransferase  42.33 
 
 
298 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0720932  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00406  putative acyltransferase  43.57 
 
 
292 aa  235  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002044  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.32 
 
 
292 aa  230  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0408  putative acyltransferase  44.37 
 
 
307 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0148  putative acyltransferase  38.41 
 
 
296 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.28872  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03629  putative acyltransferase  43.92 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2177  putative acyltransferase  38.08 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000219754  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2088  putative acyltransferase  36.75 
 
 
322 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0043  putative acyltransferase  37.63 
 
 
289 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2147  putative acyltransferase  35.79 
 
 
328 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0632358  normal  0.568225 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1316  putative acyltransferase  36.67 
 
 
320 aa  199  6e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1105  putative acyltransferase  36.3 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0819503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3557  putative acyltransferase  34.13 
 
 
326 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.554768  normal  0.229359 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02990  acyltransferase, putative  25.19 
 
 
419 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.435326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3116  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  27.27 
 
 
234 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0363  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.37 
 
 
234 aa  49.7  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000581696  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02330  transferase, putative  25.81 
 
 
783 aa  49.3  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.795386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>