52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2674 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2674  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  745    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0092  hypothetical protein  26.36 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1609  surface layer protein  27.59 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0932034  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  27.07 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5794  hypothetical protein  25.48 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0956926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.84 
 
 		 752 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1874  hypothetical protein  24 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34 
 
 		 971 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  28.28 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.65 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  30.77 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  32.61 
 
 		 819 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  29.71 
 
 		 479 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.76 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1789  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.21 
 
 		 336 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.08 
 
 		 312 aa  53.5  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.71 
 
 		 556 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.03 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4099  hypothetical protein  27.06 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  38.4 
 
 		 154 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5324  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.17 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0700232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1919  hypothetical protein  27.35 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.268267  normal  0.285057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.69 
 
 		 810 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  28.69 
 
 		 1094 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  32.1 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  33.52 
 
 		 354 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.14 
 
 		 314 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  30.7 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  26.17 
 
 		 580 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  44.58 
 
 		 192 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  37.4 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.15 
 
 		 689 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  24.83 
 
 		 1667 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.65 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.41 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.64 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.55 
 
 		 318 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.63 
 
 		 354 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  26.59 
 
 		 329 aa  46.6  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1165  hypothetical protein  23.9 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.49 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.56 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.3 
 
 		 272 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.34 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1949 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.55 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.27 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0105  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  39.29 
 
 		 140 aa  43.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4401  hypothetical protein  29.68 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4245  hypothetical protein  29.68 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203557  normal  0.147788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4179  hypothetical protein  29.68 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.21 
 
 		 314 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>