24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1919 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1919  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  761    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.268267  normal  0.285057 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3942  hypothetical protein  60.34 
 
 		 383 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437701  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1874  hypothetical protein  58.15 
 
 		 385 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1921  hypothetical protein  32.82 
 
 		 376 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223609  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0092  hypothetical protein  27.97 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6172  hypothetical protein  26.85 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.107174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1609  surface layer protein  22.37 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0932034  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  26.58 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4099  hypothetical protein  26.42 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5794  hypothetical protein  25 
 
 		 351 aa  57  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0956926 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.73 
 
 		 810 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.21 
 
 		 354 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  28.81 
 
 		 971 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.17 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.82 
 
 		 1667 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  32.93 
 
 		 387 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2728  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.93 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.171718  normal  0.304342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  26.76 
 
 		 335 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  28.95 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  27.32 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.35 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.81 
 
 		 348 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2674  hypothetical protein  27.09 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.7 
 
 		 517 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>