13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5794 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5794  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  712    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0956926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4099  hypothetical protein  41.26 
 
 		 361 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1609  surface layer protein  28.37 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0932034  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0092  hypothetical protein  28.33 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  27.84 
 
 		 465 aa  82.4  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1874  hypothetical protein  26.45 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3942  hypothetical protein  27.8 
 
 		 383 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437701  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2674  hypothetical protein  25.48 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1919  hypothetical protein  25 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.268267  normal  0.285057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  23.15 
 
 		 810 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0625  hypothetical protein  25.29 
 
 		 376 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.1 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  26.99 
 
 		 580 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>