14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1609 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1609  surface layer protein  100 
 
 		 340 aa  687    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0932034  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5794  hypothetical protein  28.12 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0956926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  28.57 
 
 		 465 aa  97.1  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0092  hypothetical protein  28.02 
 
 		 355 aa  90.1  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3942  hypothetical protein  25.44 
 
 		 383 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437701  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4099  hypothetical protein  29.75 
 
 		 361 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1874  hypothetical protein  23.4 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2674  hypothetical protein  26.96 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1919  hypothetical protein  22.37 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.268267  normal  0.285057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1921  hypothetical protein  26.19 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223609  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1667 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.51 
 
 		 353 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.44 
 
 		 752 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.45 
 
 		 329 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>