33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3942 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3942  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  781    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.437701  normal  0.295957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1919  hypothetical protein  59.03 
 
 		 374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.268267  normal  0.285057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1874  hypothetical protein  56.5 
 
 		 385 aa  426  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1921  hypothetical protein  31.33 
 
 		 376 aa  149  7e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223609  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1609  surface layer protein  25.27 
 
 		 340 aa  89.7  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0932034  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0092  hypothetical protein  26.84 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12503  putative surface layer protein  27.59 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6172  hypothetical protein  26.32 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  0.107174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5794  hypothetical protein  27.8 
 
 		 351 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0956926 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4099  hypothetical protein  21.83 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.74 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30 
 
 		 810 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  27.06 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.41 
 
 		 752 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  29.85 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.91 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  28.95 
 
 		 335 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  31.07 
 
 		 487 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1667 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.51 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.27 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2950  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.18 
 
 		 821 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0877418  normal  0.740521 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.89 
 
 		 1094 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  27.14 
 
 		 479 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  25.42 
 
 		 971 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.24 
 
 		 316 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2513  hypothetical protein  31.82 
 
 		 329 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.43 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3795  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.1 
 
 		 493 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06180  YVTN family beta-propeller repeat protein  36.49 
 
 		 408 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.24 
 
 		 314 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 492 aa  43.5  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.484183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>