38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1878 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1878  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 320 aa  633  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.176137  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4412  hypothetical protein  29.33 
 
 		 787 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00112817  normal  0.0579767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3445  hypothetical protein  29.33 
 
 		 842 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132322 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3705  protein of unknown function DUF88  29.93 
 
 		 600 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000821311  hitchhiker  0.0000382798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3241  hypothetical protein  24.12 
 
 		 789 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2817  hypothetical protein  32.18 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.556577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0007  hypothetical protein  24.5 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  24.58 
 
 		 408 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2999  protein of unknown function DUF88  32.18 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2905  protein of unknown function DUF88  32.18 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.489552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1734  hypothetical protein  32.69 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1190  protein of unknown function DUF88  26.2 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1700  protein of unknown function DUF88  26.88 
 
 		 564 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0123455  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0541  hypothetical protein  26.88 
 
 		 440 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3120  hypothetical protein  24.55 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.462437  normal  0.0322119 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0532  protein of unknown function DUF88  25.49 
 
 		 321 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2205  hypothetical protein  26.25 
 
 		 381 aa  50.4  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3452  hypothetical protein  27.27 
 
 		 282 aa  50.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3809  protein of unknown function DUF88  26.42 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.410999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3191  protein of unknown function DUF88  25.47 
 
 		 478 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000122431  normal  0.16823 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0980  protein of unknown function DUF88  21.88 
 
 		 260 aa  49.7  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0775  hypothetical protein  25.47 
 
 		 480 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.193151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1072  hypothetical protein  24.71 
 
 		 501 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0347  hypothetical protein  25.95 
 
 		 483 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1099  hypothetical protein  25.95 
 
 		 472 aa  48.5  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.167735  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1798  hypothetical protein  25.95 
 
 		 483 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1883  hypothetical protein  25.95 
 
 		 477 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.148092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1072  hypothetical protein  24.71 
 
 		 507 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0714  hypothetical protein  24.12 
 
 		 498 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1168  hypothetical protein  24.12 
 
 		 498 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0240517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4302  hypothetical protein  24.12 
 
 		 496 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160322  normal  0.186883 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1193  hypothetical protein  24.12 
 
 		 498 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04690  hypothetical protein  29.92 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2113  hypothetical protein  25.62 
 
 		 508 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.827349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2469  protein of unknown function DUF88  25 
 
 		 629 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3189  hypothetical protein  24.22 
 
 		 421 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1940  hypothetical protein  24.06 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0056  protein of unknown function DUF88  26.4 
 
 		 448 aa  42.4  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>