17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01966 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01966  putative lipoprotein  100 
 
 		 215 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399653  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3558  TPR repeat-containing protein  53.05 
 
 		 212 aa  208  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  normal  0.636992 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3646  putative lipoprotein  57.39 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2640  tetratricopeptide TPR_2  54.25 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0079338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0466  TPR repeat-containing protein  54.25 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00455074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3636  TPR repeat-containing protein  62.26 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0116122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3661  TPR repeat-containing protein  62.26 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0444  TPR repeat-containing protein  54.25 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.603542  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0380  TPR repeat-containing protein  54.03 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0527182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0401  TPR repeat-containing protein  54.03 
 
 		 212 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000198754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2965  putative lipoprotein  56.9 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2931  TPR repeat-containing protein  52.11 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.02 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643294  hitchhiker  0.00900686 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2178  putative lipoprotein  46.89 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02044  TPR repeat protein  45.38 
 
 		 162 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 393 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  29.23 
 
 		 395 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>