18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3558 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3558  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 212 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  normal  0.636992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2640  tetratricopeptide TPR_2  82.71 
 
 		 211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0079338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0466  TPR repeat-containing protein  82.71 
 
 		 211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00455074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0444  TPR repeat-containing protein  82.71 
 
 		 211 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.603542  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0380  TPR repeat-containing protein  80.09 
 
 		 212 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0527182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0401  TPR repeat-containing protein  80.09 
 
 		 212 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000198754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2931  TPR repeat-containing protein  76.17 
 
 		 210 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2965  putative lipoprotein  70.87 
 
 		 229 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3646  putative lipoprotein  72.12 
 
 		 223 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3636  TPR repeat-containing protein  70.09 
 
 		 211 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0116122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3661  TPR repeat-containing protein  70.09 
 
 		 211 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  75.42 
 
 		 227 aa  262  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643294  hitchhiker  0.00900686 
 
 
-
 
NC_003296  RS01966  putative lipoprotein  52.56 
 
 		 215 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399653  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2178  putative lipoprotein  50 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02044  TPR repeat protein  46.4 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  31.43 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.37 
 
 		 602 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 393 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>