15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02044 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02044  TPR repeat protein  100 
 
 		 162 aa  322  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3636  TPR repeat-containing protein  45.86 
 
 		 211 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0116122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3661  TPR repeat-containing protein  45.86 
 
 		 211 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3646  putative lipoprotein  45.86 
 
 		 223 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2965  putative lipoprotein  45.86 
 
 		 229 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01966  putative lipoprotein  43.88 
 
 		 215 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399653  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2640  tetratricopeptide TPR_2  47.24 
 
 		 211 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0079338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0466  TPR repeat-containing protein  47.24 
 
 		 211 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00455074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0444  TPR repeat-containing protein  47.24 
 
 		 211 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.603542  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.67 
 
 		 227 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643294  hitchhiker  0.00900686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0380  TPR repeat-containing protein  46.32 
 
 		 212 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0527182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0401  TPR repeat-containing protein  46.32 
 
 		 212 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000198754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2178  putative lipoprotein  46.83 
 
 		 205 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3558  TPR repeat-containing protein  40.46 
 
 		 212 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  normal  0.636992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2931  TPR repeat-containing protein  44.36 
 
 		 210 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>