17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2931 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2931  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
210 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110791  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3558  TPR repeat-containing protein  79.44 
 
 
212 aa  324  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  normal  0.636992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0380  TPR repeat-containing protein  82.08 
 
 
212 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0527182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0401  TPR repeat-containing protein  82.08 
 
 
212 aa  315  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000198754  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2640  tetratricopeptide TPR_2  79.25 
 
 
211 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0079338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0466  TPR repeat-containing protein  79.25 
 
 
211 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00455074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0444  TPR repeat-containing protein  79.25 
 
 
211 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.603542  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3646  putative lipoprotein  73.21 
 
 
223 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2965  putative lipoprotein  70.87 
 
 
229 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3636  TPR repeat-containing protein  71.23 
 
 
211 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0116122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3661  TPR repeat-containing protein  71.23 
 
 
211 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  66.09 
 
 
227 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643294  hitchhiker  0.00900686 
 
 
-
 
NC_003296  RS01966  putative lipoprotein  50.94 
 
 
215 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399653  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2178  putative lipoprotein  43.87 
 
 
205 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103894  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02044  TPR repeat protein  40.7 
 
 
162 aa  105  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  35.71 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4676  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.41 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>