16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0380 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0380  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
212 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0527182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0401  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
212 aa  417  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000198754  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2640  tetratricopeptide TPR_2  87.32 
 
 
211 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0079338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0466  TPR repeat-containing protein  87.32 
 
 
211 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00455074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0444  TPR repeat-containing protein  87.32 
 
 
211 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.603542  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3558  TPR repeat-containing protein  81.48 
 
 
212 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  normal  0.636992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2931  TPR repeat-containing protein  82.08 
 
 
210 aa  317  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110791  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3646  putative lipoprotein  72.69 
 
 
223 aa  298  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2965  putative lipoprotein  72.05 
 
 
229 aa  298  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3636  TPR repeat-containing protein  70.7 
 
 
211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0116122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3661  TPR repeat-containing protein  70.7 
 
 
211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  68.42 
 
 
227 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643294  hitchhiker  0.00900686 
 
 
-
 
NC_003296  RS01966  putative lipoprotein  55.81 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399653  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2178  putative lipoprotein  45.75 
 
 
205 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103894  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02044  TPR repeat protein  46.97 
 
 
162 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  35.71 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>