18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0444 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2640  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
211 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0079338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0466  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
211 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00455074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0444  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
211 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.603542  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3558  TPR repeat-containing protein  82.71 
 
 
212 aa  333  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  normal  0.636992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0380  TPR repeat-containing protein  84.51 
 
 
212 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0527182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0401  TPR repeat-containing protein  84.51 
 
 
212 aa  332  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000198754  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2931  TPR repeat-containing protein  79.91 
 
 
210 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110791  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2965  putative lipoprotein  85.23 
 
 
229 aa  296  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3646  putative lipoprotein  84.66 
 
 
223 aa  295  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3636  TPR repeat-containing protein  82.93 
 
 
211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0116122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3661  TPR repeat-containing protein  82.93 
 
 
211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  76.4 
 
 
227 aa  262  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643294  hitchhiker  0.00900686 
 
 
-
 
NC_003296  RS01966  putative lipoprotein  54.63 
 
 
215 aa  199  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399653  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2178  putative lipoprotein  45.75 
 
 
205 aa  148  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103894  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02044  TPR repeat protein  47.24 
 
 
162 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1657  hypothetical protein  31.43 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459184  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
393 aa  42.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.37 
 
 
602 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>