16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4912 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4912  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 227 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000643294  hitchhiker  0.00900686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3646  putative lipoprotein  70.18 
 
 		 223 aa  287  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0108842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2965  putative lipoprotein  68.8 
 
 		 229 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3558  TPR repeat-containing protein  64.94 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  normal  0.636992 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3636  TPR repeat-containing protein  69.91 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0116122  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3661  TPR repeat-containing protein  69.91 
 
 		 211 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2931  TPR repeat-containing protein  66.09 
 
 		 210 aa  264  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0380  TPR repeat-containing protein  68.28 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0527182  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0401  TPR repeat-containing protein  68.28 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000198754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2640  tetratricopeptide TPR_2  76.4 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0079338  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0466  TPR repeat-containing protein  76.4 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00455074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0444  TPR repeat-containing protein  76.4 
 
 		 211 aa  259  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.603542  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_003296  RS01966  putative lipoprotein  48.91 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399653  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2178  putative lipoprotein  47.85 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02044  TPR repeat protein  42.65 
 
 		 162 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  30.48 
 
 		 661 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>