More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0424 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 199 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  90.95 
 
 		 199 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  89.39 
 
 		 199 aa  358  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  84.85 
 
 		 199 aa  337  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  79.29 
 
 		 199 aa  318  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  79.8 
 
 		 199 aa  307  8e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  78.79 
 
 		 199 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  61.54 
 
 		 222 aa  243  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  56.15 
 
 		 194 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  58.46 
 
 		 200 aa  227  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  57.95 
 
 		 200 aa  225  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  55.33 
 
 		 200 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  55.85 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  54.5 
 
 		 203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  54.79 
 
 		 194 aa  215  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  52.38 
 
 		 195 aa  209  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  51.01 
 
 		 211 aa  201  5e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  55.26 
 
 		 207 aa  201  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  54.21 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  52.91 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  56.25 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  53.33 
 
 		 206 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  53.68 
 
 		 217 aa  190  9e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  55.21 
 
 		 207 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  52.63 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  52.6 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  48.95 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  45.41 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  47.73 
 
 		 204 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  50.57 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  49.47 
 
 		 197 aa  167  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  45.83 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  49.2 
 
 		 197 aa  165  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  47.74 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  47.87 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  48.44 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  42.86 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  47.87 
 
 		 197 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  50 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  47.16 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  44.75 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  41.45 
 
 		 211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  39.71 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  39.57 
 
 		 200 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  34.02 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  39.13 
 
 		 207 aa  123  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  38.73 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  43.39 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  39.79 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 		 208 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  34.55 
 
 		 197 aa  115  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  36 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  37.11 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  38.33 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  35.79 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  34.41 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  34.66 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  34.92 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  32.98 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  33.68 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4180  dephospho-CoA kinase  36.27 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376004  unclonable  0.000000000202737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  36.95 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  36.72 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  35.29 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  31.58 
 
 		 297 aa  109  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  38.76 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  40.78 
 
 		 210 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  35.05 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2167  dephospho-CoA kinase  36.98 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.993238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  35.11 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  34.57 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3643  dephospho-CoA kinase  36.81 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000484329  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0185  kinase, putative  36.51 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  39.89 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  32.09 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  37.31 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  35.98 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  34.18 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 		 207 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  36.79 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  36.65 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  36.79 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  35.79 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  33.5 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0108  dephospho-CoA kinase  34.08 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  34.38 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  37.89 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  33.67 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  35.51 
 
 		 202 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  35.8 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>