More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3212 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  60.94 
 
 		 203 aa  241  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  58.64 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  58.2 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  55.5 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  56.08 
 
 		 199 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  54.12 
 
 		 195 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  57.81 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  54.79 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  54.97 
 
 		 200 aa  215  2.9999999999999998e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  54.45 
 
 		 200 aa  213  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 		 194 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  54.26 
 
 		 199 aa  209  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  53.19 
 
 		 199 aa  207  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  56.12 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  55.15 
 
 		 208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  50 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  53.72 
 
 		 199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  52.31 
 
 		 200 aa  191  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  53.19 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  52.33 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  51.3 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  52.55 
 
 		 207 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  51.55 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  51.81 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  50.78 
 
 		 212 aa  184  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  52.04 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  48.96 
 
 		 200 aa  177  8e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  48.42 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  49.74 
 
 		 201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  54.55 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  48.98 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  49.47 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  48.31 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  46.6 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  48.44 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  45.55 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  45.55 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  51.56 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  50.78 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  46.6 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  46.32 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  44.79 
 
 		 219 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  36.95 
 
 		 211 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  38.66 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  38.14 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  37.19 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  35.45 
 
 		 205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  34.92 
 
 		 205 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  37.23 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  38.07 
 
 		 200 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  38.14 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  39.58 
 
 		 202 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  38.14 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  36.13 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  40.21 
 
 		 202 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  34.39 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0185  kinase, putative  38.46 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  37.97 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  34.92 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  38.14 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  37.7 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  36.45 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  37.63 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  35.6 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  35.08 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  35.96 
 
 		 211 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  31.18 
 
 		 209 aa  115  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  36.68 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  34.69 
 
 		 297 aa  113  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  37.11 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0860  phosphoribosylglycinamide formyltransferase  32.31 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  40.3 
 
 		 203 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  33.71 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  37.77 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  37.43 
 
 		 204 aa  111  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  34.38 
 
 		 205 aa  111  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  32.39 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0774  dephospho-CoA kinase  36.61 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.448026  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  33.89 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0302  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  34.67 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  35.36 
 
 		 206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  38.38 
 
 		 206 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  38.74 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  38.04 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  35.36 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2821  dephospho-CoA kinase  35.9 
 
 		 205 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  38.38 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  37.06 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  35.36 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  31.98 
 
 		 206 aa  107  8.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0801  dephospho-CoA kinase  30.41 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.178857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  32.63 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  34.03 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3579  dephospho-CoA kinase  34.25 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00275387  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  34.03 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  33.52 
 
 		 201 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>