More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1488 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
217 aa  423  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  96.77 
 
 
217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  91.18 
 
 
206 aa  334  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  72.11 
 
 
204 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  73.74 
 
 
212 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  70 
 
 
207 aa  226  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  65.28 
 
 
200 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  59.07 
 
 
194 aa  217  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  58.03 
 
 
222 aa  208  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  56.25 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  57.36 
 
 
201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  58.79 
 
 
207 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  54 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  54.21 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  54.4 
 
 
200 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  54.08 
 
 
208 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  53.37 
 
 
200 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
199 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  57.3 
 
 
201 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  53 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  52.33 
 
 
194 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  57.89 
 
 
211 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  56.48 
 
 
197 aa  187  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 
200 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  54.64 
 
 
202 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  52.79 
 
 
203 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  53.4 
 
 
195 aa  185  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  55.96 
 
 
197 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  56.61 
 
 
199 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  55.44 
 
 
197 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  58.72 
 
 
207 aa  181  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  53.44 
 
 
194 aa  181  7e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  56.82 
 
 
198 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  62.71 
 
 
198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  50.75 
 
 
199 aa  176  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 
197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  52.38 
 
 
201 aa  170  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  54.89 
 
 
229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  52.87 
 
 
204 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  43.3 
 
 
200 aa  154  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  56.32 
 
 
215 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  42.71 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  42.79 
 
 
211 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
202 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  42.79 
 
 
211 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  42.79 
 
 
211 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  44.69 
 
 
201 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  44.34 
 
 
210 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  35.2 
 
 
199 aa  121  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  43.86 
 
 
202 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  43.16 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  45.03 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  43.08 
 
 
202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  42.11 
 
 
214 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  41.58 
 
 
202 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  40.21 
 
 
220 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  44.09 
 
 
201 aa  118  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  43.27 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  40.8 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  41.86 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  31.98 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  42.78 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  43.27 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  34.36 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  43.27 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 
200 aa  116  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  46.02 
 
 
192 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  41.31 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  38.59 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  43.1 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1192  dephospho-CoA kinase  41.62 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  39.18 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12060  dephospho-CoA kinase  36.84 
 
 
202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00111061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  38.95 
 
 
207 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  41.52 
 
 
202 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2828  dephospho-CoA kinase  42.39 
 
 
204 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103932  normal  0.134526 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  45.61 
 
 
202 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  37.04 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3073  dephospho-CoA kinase  42.31 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.577985  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2708  dephospho-CoA kinase  42.31 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  37.04 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  31.44 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41000  Dephospho-CoA kinase (Dephosphocoenzyme A kinase) (COAE)  36.54 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.495473  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  39.36 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  36.46 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  41.9 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  32.81 
 
 
203 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1625  dephospho-CoA kinase  37.95 
 
 
229 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  39.31 
 
 
207 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  40.68 
 
 
200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  40.2 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  40.22 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  34.02 
 
 
198 aa  108  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  40.68 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  36.21 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  40.11 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  36.21 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>