More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0104 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
199 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  87.88 
 
 
199 aa  351  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  79.8 
 
 
199 aa  318  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  80.3 
 
 
199 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  79.26 
 
 
199 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  72.36 
 
 
199 aa  293  8e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  75.38 
 
 
199 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  61.03 
 
 
222 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  58.46 
 
 
200 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  57.95 
 
 
200 aa  227  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  54.55 
 
 
194 aa  221  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  55.84 
 
 
200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  54.5 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  54.26 
 
 
201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  53.72 
 
 
194 aa  205  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  51.85 
 
 
195 aa  204  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  51.26 
 
 
211 aa  201  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  53.44 
 
 
203 aa  197  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  55.26 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  54.69 
 
 
208 aa  191  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  50.75 
 
 
217 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  50.75 
 
 
217 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  52.11 
 
 
206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  52.11 
 
 
212 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  48.95 
 
 
200 aa  176  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  51.56 
 
 
207 aa  174  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  49.47 
 
 
197 aa  174  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  48.99 
 
 
201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  49.74 
 
 
202 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  46.43 
 
 
198 aa  170  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  50 
 
 
204 aa  168  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  47.73 
 
 
204 aa  166  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  48.15 
 
 
198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  46.81 
 
 
194 aa  165  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  47.34 
 
 
197 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  47.34 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  42.35 
 
 
200 aa  162  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  50.58 
 
 
197 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  47.92 
 
 
201 aa  159  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  47.57 
 
 
207 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  48.31 
 
 
229 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  45.55 
 
 
215 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  42.27 
 
 
201 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  39.89 
 
 
207 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  32.99 
 
 
198 aa  122  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  40.93 
 
 
200 aa  121  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  33.68 
 
 
297 aa  116  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  40.82 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  33.69 
 
 
201 aa  115  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  34.03 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  40.31 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  36.51 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  34.2 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  40.82 
 
 
211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  41.21 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  36.6 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  36.6 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  35.6 
 
 
200 aa  111  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  35.75 
 
 
205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  35.6 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  36.6 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  30.37 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  36.6 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  36.13 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  36.6 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  36.6 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  35.64 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  35.29 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  35.45 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  33.67 
 
 
205 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  34.04 
 
 
205 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
205 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  35.57 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
205 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  38.61 
 
 
211 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4180  dephospho-CoA kinase  36.87 
 
 
204 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376004  unclonable  0.000000000202737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0417  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
205 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3426  dephospho-CoA kinase  32.81 
 
 
205 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  35.05 
 
 
199 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1193  dephospho-CoA kinase  30.26 
 
 
208 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.53954  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  32.45 
 
 
205 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_002978  WD0185  kinase, putative  35.98 
 
 
195 aa  105  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  40.88 
 
 
210 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  31.53 
 
 
205 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  39 
 
 
202 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  36.55 
 
 
220 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  40.57 
 
 
198 aa  102  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  34.02 
 
 
200 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1022  dephospho-CoA kinase  35.68 
 
 
204 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  36.87 
 
 
202 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  38.76 
 
 
203 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0108  dephospho-CoA kinase  32.97 
 
 
201 aa  100  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  37.37 
 
 
200 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  38.42 
 
 
200 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  34.55 
 
 
201 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  37.75 
 
 
210 aa  99.4  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  32.09 
 
 
201 aa  99  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  35.05 
 
 
206 aa  99  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>