More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2538 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  65.62 
 
 		 200 aa  253  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  62.69 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  57.81 
 
 		 199 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  57.29 
 
 		 199 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  55.85 
 
 		 199 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  55.5 
 
 		 199 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  56.91 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  53.37 
 
 		 194 aa  208  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  54.17 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  56.77 
 
 		 199 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  51 
 
 		 200 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  57.23 
 
 		 222 aa  200  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  50.5 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  50.79 
 
 		 195 aa  198  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  50 
 
 		 194 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  57.3 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  57.3 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  53.65 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  54.4 
 
 		 206 aa  184  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  54.82 
 
 		 207 aa  184  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  48.91 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  50.25 
 
 		 200 aa  181  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  51.3 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  50.54 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  54.36 
 
 		 204 aa  175  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  53.61 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  50.29 
 
 		 198 aa  167  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  51.72 
 
 		 198 aa  167  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  53.23 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  51.14 
 
 		 204 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  48.21 
 
 		 202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 		 197 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  53.68 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  51.35 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  48.47 
 
 		 197 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  48.85 
 
 		 194 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  48.47 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  50.52 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  50 
 
 		 215 aa  149  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  44.57 
 
 		 197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  40.31 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  39.36 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  46.37 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  46.07 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  42.21 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  37.19 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  39.59 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  42.7 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  38.38 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  38.73 
 
 		 220 aa  104  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  30.41 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  41.34 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  41.24 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  40.74 
 
 		 207 aa  101  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  34.57 
 
 		 198 aa  99.8  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  36.17 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0185  kinase, putative  35.08 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  29.08 
 
 		 297 aa  97.4  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  33.52 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  32.39 
 
 		 209 aa  95.5  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  31.43 
 
 		 198 aa  94.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  40.12 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  40.12 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  40.12 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  40.12 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  40.12 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  33.5 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  39.51 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  32.31 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  38.27 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  40.12 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  32.77 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  33.16 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  35.59 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  36.16 
 
 		 207 aa  93.2  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  34.22 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0802  dephospho-CoA kinase  38.1 
 
 		 207 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  0.626874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2130  dephospho-CoA kinase  33.99 
 
 		 200 aa  92.4  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  32.31 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0765  dephospho-CoA kinase  37.57 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0422  dephospho-CoA kinase  31.82 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000341611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  34.43 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  32.39 
 
 		 218 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  32.62 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  35.55 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  36.13 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  36.31 
 
 		 210 aa  90.1  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  30.46 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1889  dephospho-CoA kinase  31.25 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  34.66 
 
 		 205 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  38.89 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  38.89 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  34.09 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  34.66 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>