More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0114 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
201 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  58.67 
 
 
202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  61.11 
 
 
207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  57.36 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  61.05 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  55.26 
 
 
211 aa  191  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  57.87 
 
 
206 aa  189  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  55.03 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  57.29 
 
 
200 aa  188  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  53.68 
 
 
201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
204 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  52.91 
 
 
199 aa  181  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  52.36 
 
 
199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  50.77 
 
 
201 aa  178  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  54.59 
 
 
207 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  51.6 
 
 
199 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 
199 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 
200 aa  175  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 
200 aa  174  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  52 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  51.31 
 
 
199 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  49.74 
 
 
194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  51.78 
 
 
207 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  56.57 
 
 
212 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  51.83 
 
 
195 aa  167  8e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  51.79 
 
 
198 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  46.63 
 
 
200 aa  165  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  48.99 
 
 
199 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  47.98 
 
 
203 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  51.05 
 
 
199 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  47.96 
 
 
208 aa  161  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  48.96 
 
 
194 aa  161  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  48.72 
 
 
197 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  49.48 
 
 
197 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 
198 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  47.72 
 
 
203 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  54.75 
 
 
229 aa  158  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  48.45 
 
 
197 aa  157  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  48.33 
 
 
204 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  41.88 
 
 
200 aa  139  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  44.56 
 
 
197 aa  139  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  40.91 
 
 
200 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  47.16 
 
 
211 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  47.87 
 
 
215 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  47.43 
 
 
210 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  46.59 
 
 
211 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  45.71 
 
 
211 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  40.91 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  36.32 
 
 
199 aa  118  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  42.77 
 
 
207 aa  118  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  40.1 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  35.53 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  39.3 
 
 
202 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  40.93 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3026  dephospho-CoA kinase  39.71 
 
 
201 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00288343  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  30.54 
 
 
198 aa  111  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  38.22 
 
 
204 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  41.4 
 
 
202 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  39.89 
 
 
207 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  40.31 
 
 
211 aa  107  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0187  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 
204 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.89848  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  38.42 
 
 
201 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0366  dephospho-CoA kinase  39.9 
 
 
204 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473832  normal  0.422863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  37.19 
 
 
220 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  36.32 
 
 
198 aa  105  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  38.61 
 
 
208 aa  106  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  41.04 
 
 
202 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  36.59 
 
 
210 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 
219 aa  105  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  39.56 
 
 
202 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  37.31 
 
 
205 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  39.22 
 
 
203 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1889  dephospho-CoA kinase  34.36 
 
 
196 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13000  dephospho-CoA kinase  40.5 
 
 
200 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0183  dephospho-CoA kinase  34.15 
 
 
206 aa  103  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.26164  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0199  dephospho-CoA kinase  34.83 
 
 
204 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.325208 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  32.14 
 
 
198 aa  102  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1193  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
208 aa  101  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.53954  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  35.75 
 
 
200 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3605  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
195 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.934183  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0108  dephospho-CoA kinase  31.75 
 
 
201 aa  100  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
199 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0757  dephospho-CoA kinase  40.31 
 
 
211 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0784  Dephospho-CoA kinase  36.13 
 
 
201 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.134619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3643  dephospho-CoA kinase  36.51 
 
 
215 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000484329  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  34.72 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  38.2 
 
 
197 aa  98.6  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  31.05 
 
 
297 aa  98.6  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2905  dephospho-CoA kinase  36.98 
 
 
212 aa  98.6  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  34.92 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  39.88 
 
 
202 aa  98.6  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2048  dephospho-CoA kinase  37.1 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154504  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2501  dephospho-CoA kinase  32.97 
 
 
195 aa  97.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  38.95 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  35.23 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  39.68 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4180  dephospho-CoA kinase  38.22 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376004  unclonable  0.000000000202737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2356  dephospho-CoA kinase  37.57 
 
 
202 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000670117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1192  dephospho-CoA kinase  39.78 
 
 
210 aa  96.3  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.257852  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1232  dephospho-CoA kinase  41.62 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.139689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>