More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4284 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  100 
 
 
212 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  74.24 
 
 
217 aa  276  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  74.11 
 
 
217 aa  274  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  77.6 
 
 
206 aa  258  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  77.84 
 
 
204 aa  257  9e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  78.07 
 
 
207 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  67.18 
 
 
200 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  55.67 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  60.8 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  56.65 
 
 
222 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  61.66 
 
 
207 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  58.2 
 
 
199 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  55.44 
 
 
194 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  57.07 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  55.17 
 
 
199 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  56.54 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  56.32 
 
 
199 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  56.84 
 
 
199 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  61.67 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  56.02 
 
 
200 aa  194  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  54.12 
 
 
200 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  56.57 
 
 
201 aa  192  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  60 
 
 
211 aa  191  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  53.61 
 
 
200 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  51.49 
 
 
203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  55.26 
 
 
199 aa  185  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  60.7 
 
 
198 aa  185  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  54.74 
 
 
194 aa  185  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  56.99 
 
 
201 aa  184  7e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  57.71 
 
 
198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 
199 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  52.33 
 
 
203 aa  177  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  56.08 
 
 
197 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  53.65 
 
 
202 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  55.56 
 
 
197 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  55.56 
 
 
197 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  56 
 
 
204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  58.47 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  53.44 
 
 
201 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  54.21 
 
 
197 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  44.04 
 
 
200 aa  158  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  58.86 
 
 
215 aa  152  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  44.38 
 
 
201 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  47.46 
 
 
203 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4823  dephospho-CoA kinase  40.2 
 
 
207 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  43.98 
 
 
204 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  44.19 
 
 
207 aa  121  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  48 
 
 
211 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  47.43 
 
 
211 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  44.44 
 
 
202 aa  119  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  48 
 
 
211 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  34.46 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0677  dephospho-CoA kinase  39.29 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  43.86 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0631  dephospho-CoA kinase  38.78 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0672  dephospho-CoA kinase  38.78 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0597341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0772  dephospho-CoA kinase  41.12 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  46.86 
 
 
210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  44.25 
 
 
207 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  34.22 
 
 
205 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  41.57 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  45.95 
 
 
198 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  35.57 
 
 
200 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  31.09 
 
 
209 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  37.77 
 
 
200 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  34.69 
 
 
200 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  35.05 
 
 
199 aa  111  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  36.6 
 
 
220 aa  111  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  42.11 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1420  dephospho-CoA kinase  40.53 
 
 
218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  40 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  37.25 
 
 
207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0923  dephospho-CoA kinase  34.31 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  42.69 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  40.46 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  39.3 
 
 
211 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  38.29 
 
 
200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  42.11 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  42.11 
 
 
202 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  42.11 
 
 
202 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 
205 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2356  dephospho-CoA kinase  38.31 
 
 
202 aa  108  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000670117  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
205 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  37.85 
 
 
200 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2177  dephospho-CoA kinase  36.1 
 
 
212 aa  108  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295249  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2316  dephospho-CoA kinase  30.15 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0795  dephospho-CoA kinase  34.31 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3503  dephospho-CoA kinase  39.43 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00196756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3269  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
200 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000097205  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3374  dephospho-CoA kinase  39.43 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1045  dephospho-CoA kinase  39.43 
 
 
206 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.658555  normal  0.0279991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5165  dephospho-CoA kinase  37.7 
 
 
203 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3922  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 
205 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 
200 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58780  dephospho-CoA kinase  37.17 
 
 
203 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.418465  normal  0.492269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  32.61 
 
 
201 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>