36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3158 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  314  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  61.78 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  64.14 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  64.14 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  62.76 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  49.32 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2340  integral membrane protein  61.22 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  50.72 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  48.87 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  47.74 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  47.48 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  46.76 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  44.96 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  45.97 
 
 		 178 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  41.67 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  45.07 
 
 		 148 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  38.36 
 
 		 162 aa  80.5  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  41.86 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  37.78 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  31.62 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  35.1 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  34.78 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  26.92 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  35.46 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  36.11 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  34.48 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  39.72 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  32.62 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  28.08 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  29.08 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  26.32 
 
 		 284 aa  48.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  31.25 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3352  hypothetical protein  32.89 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  37.06 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3627  hypothetical protein  30.84 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>