11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3352 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3352  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  329  9e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2374  hypothetical protein  82.61 
 
 
163 aa  267  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348169  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0059  hypothetical protein  32.87 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3627  hypothetical protein  28.47 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3582  hypothetical protein  43.28 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  28.38 
 
 
151 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2938  hypothetical protein  30.71 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418548  normal  0.0599766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1292  hypothetical protein  48.72 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  30.61 
 
 
161 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3302  hypothetical protein  36.54 
 
 
162 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  26.9 
 
 
159 aa  40.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>