27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1099 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  348  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  40.4 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  33.78 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  37.09 
 
 		 284 aa  97.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  35.25 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  29.27 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  32.43 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  34.31 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  28.1 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  29.8 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  29.25 
 
 		 166 aa  64.3  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.41 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  29.01 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  28.08 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  25.71 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.87 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  28.86 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  26.19 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  27.52 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  27.52 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  29.69 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  26.85 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  26.35 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  27.81 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1815  integral-membrane protein  24.64 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  decreased coverage  0.00207179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3627  hypothetical protein  27.63 
 
 		 169 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  27.86 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>