30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1736 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  100 
 
 
166 aa  330  6e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  54.04 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  49.69 
 
 
172 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  45.75 
 
 
186 aa  124  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  45.64 
 
 
154 aa  117  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  47.97 
 
 
184 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  45.38 
 
 
158 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1815  integral-membrane protein  39.1 
 
 
157 aa  100  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  decreased coverage  0.00207179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  39.22 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  40.44 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  35.46 
 
 
159 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  36.24 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  35.86 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  35.95 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  38.73 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  34.01 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  37.5 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  32.21 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.37 
 
 
160 aa  58.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.52 
 
 
160 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  33.77 
 
 
161 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  39.1 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  39.1 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  39.1 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  33.81 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  29.25 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  34.78 
 
 
156 aa  51.6  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  34.07 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  33.33 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>