33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2422 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  100 
 
 		 156 aa  306  5.9999999999999995e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  62.59 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  42.67 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  42.45 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  42.38 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  43.38 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  44.85 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  47.18 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  44.27 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  44.27 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  43.51 
 
 		 161 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  39.6 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  45.04 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  40.44 
 
 		 161 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  41.43 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  38.4 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  40.54 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  35.06 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  30.82 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  38.46 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  38.51 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  36.03 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  36.92 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  36.3 
 
 		 284 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  32.87 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2340  integral membrane protein  40.91 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  32.28 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  35.82 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  29.03 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  31.45 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  33.85 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  31.25 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  33.08 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>