29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8403 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  364  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  57.32 
 
 		 170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  49.38 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  47.2 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  46.26 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  45.45 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 284 aa  89  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  42.34 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1815  integral-membrane protein  40.29 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295351  decreased coverage  0.00207179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  39.16 
 
 		 158 aa  85.5  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  38.36 
 
 		 159 aa  84.3  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  36.73 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  35.17 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  39.72 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  37.4 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  38.3 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  38.3 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  38.3 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  29.49 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  33.08 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  28.21 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  34.09 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  29.8 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  34.75 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  34.35 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  31.85 
 
 		 162 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  33.85 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  30.37 
 
 		 156 aa  44.3  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  29.46 
 
 		 178 aa  40.8  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>