33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0132 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 		 160 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  86.25 
 
 		 160 aa  268  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  51.32 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  50.72 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  51.49 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  51.49 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  50.75 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  45.45 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  47.29 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  42.31 
 
 		 156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  46.9 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  39.86 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  42.4 
 
 		 178 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  39.72 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  40.85 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  44.96 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2340  integral membrane protein  41.22 
 
 		 134 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  34.72 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  37.58 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  31.82 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  33.78 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  32.87 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  31.37 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  34.09 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  31.88 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  29.17 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  25.83 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  33.79 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  27.66 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3125  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  35.77 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0194025  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  24.67 
 
 		 284 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>