26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0510 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  337  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  34.44 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  36.3 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  32.45 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  34.29 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  33.11 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  31.88 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  30 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  34.01 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  30.61 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  33.6 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  32.62 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  30.88 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  36.11 
 
 
161 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2340  integral membrane protein  39.47 
 
 
134 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  31.21 
 
 
154 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  32.26 
 
 
160 aa  54.3  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.88 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  33.12 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  30 
 
 
284 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  31.43 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  31.43 
 
 
161 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  31.43 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  30.53 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  24.82 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  30.56 
 
 
156 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>