29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2406 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  287  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  41.55 
 
 
160 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  41.13 
 
 
160 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  39.71 
 
 
162 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  41.5 
 
 
161 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  40.15 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  41.18 
 
 
161 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  41.18 
 
 
161 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  41.18 
 
 
161 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  40.82 
 
 
159 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  42.96 
 
 
161 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  40 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  43.2 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  40 
 
 
158 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  42.64 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  42.64 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  39.62 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  41.32 
 
 
178 aa  66.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  38.17 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  28.86 
 
 
164 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3125  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  32.77 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0194025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  24.84 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  30.2 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  35.43 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  25.83 
 
 
284 aa  44.3  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  29.93 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  29.03 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  31.75 
 
 
158 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>