21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2346 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  295  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  37.12 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  42.45 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  38.93 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  40.65 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.33 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  34.03 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  30.65 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  34.04 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  37.96 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  34.33 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  34.33 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  34.85 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  28.19 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  33.58 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  35.66 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  31.13 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  33.6 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  34.21 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  35.17 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2340  integral membrane protein  33.61 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>