34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1106 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  308  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  47.89 
 
 
162 aa  142  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  45.1 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  43.23 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  54.11 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  46.85 
 
 
161 aa  124  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  48.23 
 
 
156 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  45.03 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  45.45 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  45.45 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  45.45 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  40.38 
 
 
161 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  45.65 
 
 
156 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  44.22 
 
 
178 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  40.97 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2406  hypothetical protein  42.86 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5269  hypothetical protein  37.25 
 
 
164 aa  87.8  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  32.19 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  33.13 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  35.1 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  37.58 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  32.17 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  33.33 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8403  hypothetical protein  34.35 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9343  hypothetical protein  33.57 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.354753  normal  0.737177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  30.38 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  34.25 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  33.61 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  29.85 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  28.86 
 
 
171 aa  53.9  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  30.43 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1128  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  31.39 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01431  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2340  integral membrane protein  37.29 
 
 
134 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1363  hypothetical protein  31.54 
 
 
172 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00054435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>