10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4140 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  293  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4154  hypothetical protein  34.9 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.0190549 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  29.5 
 
 		 162 aa  50.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3352  hypothetical protein  28.38 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2374  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348169  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  29.33 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2938  hypothetical protein  26.57 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418548  normal  0.0599766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  31.33 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3627  hypothetical protein  27.86 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  28.06 
 
 		 156 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>