15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2938 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2938  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  303  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418548  normal  0.0599766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1292  hypothetical protein  80.52 
 
 		 154 aa  209  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4154  hypothetical protein  30.67 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.0190549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3582  hypothetical protein  45.65 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2374  hypothetical protein  30.28 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348169  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3352  hypothetical protein  30.52 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4140  hypothetical protein  26.71 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3746  hypothetical protein  34.97 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0775427  normal  0.0498374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0162  hypothetical protein  26.35 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1566  hypothetical protein  40.35 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0246282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3627  hypothetical protein  27.74 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0059  hypothetical protein  28.47 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  27.7 
 
 		 154 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4215  hypothetical protein  46.34 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.686189  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3268  putative transmembrane protein  23.75 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.398918  normal  0.0684452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>