25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2340 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2340  integral membrane protein  100 
 
 		 134 aa  258  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3158  hypothetical protein  63.27 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6883  integral membrane protein  49.67 
 
 		 161 aa  116  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0132  conserved hypothetical conserved membrane protein  43.24 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.599894 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1549  integral membrane protein  51.09 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462747  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6280  integral membrane protein  51.09 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.104283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6772  integral membrane protein  51.09 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0135  conserved hypothetical conserved membrane protein  42.18 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2207  hypothetical protein  46.09 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.260587 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4405  hypothetical protein  35.82 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2422  putative integral membrane protein  43.93 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1649  hypothetical protein  41.18 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863009  normal  0.614735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0510  hypothetical protein  40.35 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1675  hypothetical protein  45.28 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00317924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3850  hypothetical protein  38.39 
 
 		 178 aa  63.5  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.046316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0901  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  39.47 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2346  hypothetical protein  37.82 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.262363  normal  0.01244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5073  hypothetical protein  31.25 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1243  hypothetical protein  31.4 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1736  integral membrane protein  34.71 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0853  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  37.33 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03660  predicted integral membrane protein  37.07 
 
 		 162 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2170  Protein of unknown function DUF2266, transmembrane  36.84 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82451  hitchhiker  0.000424044 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1099  hypothetical protein  29.87 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1106  hypothetical protein  37.86 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0262236  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>