37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1461 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  67.24 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  65.52 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  65.52 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  65.52 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  56.9 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  51.72 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  63.46 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  52.94 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  50.91 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  50.91 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  52.73 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  50.85 
 
 		 62 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  55.77 
 
 		 62 aa  57.4  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  60.34 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  56.9 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  47.06 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1863  hypothetical protein  68.97 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0931519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2054  hypothetical protein  68.97 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  53.19 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1731  hypothetical protein  68.97 
 
 		 63 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  52.38 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2919  hypothetical protein  53.45 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000365079  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  52.5 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  57.69 
 
 		 62 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  42.59 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  46.81 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  45.24 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4546  hypothetical protein  40.74 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.195637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1454  hypothetical protein  43.1 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1590  hypothetical protein  56.9 
 
 		 58 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1885  hypothetical protein  60.34 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1316  hypothetical protein  60.34 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.153432  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  45.24 
 
 		 77 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1793  phospholipase D/transphosphatidylase  38.78 
 
 		 497 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.734015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>