22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3633 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  117  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  76.79 
 
 
62 aa  72.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  55.56 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  52.83 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  44.64 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  42.86 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  48.98 
 
 
64 aa  50.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  42.11 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  55.77 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  49.06 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  60 
 
 
58 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  41.51 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  51.16 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  38.6 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  47.73 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  40.38 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  40.38 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  40.38 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  37.25 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2919  hypothetical protein  49.06 
 
 
81 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000365079  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  35.09 
 
 
58 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>