25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4181 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  76.79 
 
 		 62 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  59.26 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  55.56 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  55.77 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  55.77 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  48.08 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  50.94 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  51.92 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  49.06 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  48.08 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  48.08 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  48.08 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  60 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  46.3 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  43.14 
 
 		 77 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  41.94 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  38.98 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  52.83 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  48.89 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  43.75 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  44.19 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  41.67 
 
 		 77 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>