40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3586 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  93.65 
 
 
63 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  66.67 
 
 
64 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  65.08 
 
 
63 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  65.08 
 
 
63 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  63.49 
 
 
63 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1731  hypothetical protein  79.37 
 
 
63 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1863  hypothetical protein  71.43 
 
 
63 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0931519  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2054  hypothetical protein  71.43 
 
 
63 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  60 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  54.24 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  54.24 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  52.54 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1885  hypothetical protein  73.02 
 
 
63 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  47.46 
 
 
64 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  45.1 
 
 
77 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  52.83 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  43.4 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  42.37 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  41.07 
 
 
58 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  52.83 
 
 
62 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  50 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  43.33 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  43.14 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  53.57 
 
 
60 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  57.14 
 
 
58 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  48.84 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  43.4 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  57.14 
 
 
59 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4546  hypothetical protein  42.31 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.195637  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  52.83 
 
 
62 aa  47  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  45.24 
 
 
61 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1454  hypothetical protein  46.55 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2919  hypothetical protein  48.28 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000365079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0305  hypothetical protein  39.62 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  34.62 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  34.62 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  34.62 
 
 
70 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02015  hypothetical protein  31.03 
 
 
71 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3296  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000212435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>