31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3848 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  60.66 
 
 		 61 aa  77.4  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  55.93 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  55.93 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  54.24 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  53.23 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  43.75 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  40.62 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  44.07 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  49.09 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  43.14 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  44.64 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  47.06 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  59.26 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  45.76 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  45.83 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  47.73 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  45.83 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  44.19 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  47.92 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  47.46 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  35.85 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  35.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  35.85 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0516  hypothetical protein  39.06 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  40.48 
 
 		 59 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>