24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0042 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  54.55 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  53.85 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  49.06 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  39.66 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  37.93 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  37.93 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  37.93 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  44.23 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  48.21 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  48.21 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  43.14 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  46.43 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2919  hypothetical protein  47.37 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000365079  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  40.74 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  40.38 
 
 		 64 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  46.15 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0402  hypothetical protein  42 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00151461  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  42.31 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1454  hypothetical protein  52.73 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1590  hypothetical protein  53.85 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>