33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1259 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  94.03 
 
 		 67 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  55.93 
 
 		 64 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  54.24 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  52.54 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  48.21 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  50.85 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  54.72 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  54.72 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  54.72 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  43.1 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  54.24 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  52.38 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  42.86 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  48.89 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  44.23 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  51.92 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  42 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1863  hypothetical protein  55.93 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0931519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  46.81 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2054  hypothetical protein  55.93 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  55.77 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  48.21 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  52.38 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0402  hypothetical protein  44 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00151461  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  48.84 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1731  hypothetical protein  57.63 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1885  hypothetical protein  50.85 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0305  hypothetical protein  44 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>