22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3291 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  52.46 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  53.23 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  51.61 
 
 		 61 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  43.1 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  43.1 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  43.1 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  42.37 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  43.64 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  42.31 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  49.06 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  47.17 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  46.15 
 
 		 63 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  47.46 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  40.38 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1454  hypothetical protein  41.94 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  51.22 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4546  hypothetical protein  40.82 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.195637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  42.37 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>