21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1590 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1590  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2919  hypothetical protein  59.62 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000365079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  44.83 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  46.55 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  41.38 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  51.92 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  40.68 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  51.72 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  44.83 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  53.66 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  56.9 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  41.38 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  41.38 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  44.23 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  41.38 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  42.86 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  42.86 
 
 		 67 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  45 
 
 		 61 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>